Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms