Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms