Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNDQ07001 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNDQ07001 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNDQ07001 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms