Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBQ06643 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBQ06643 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBQ06643 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBQ06643 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBQ06643 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBQ06643 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBQ06643 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBQ06643 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBQ06643 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBQ06643 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBQ06643 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBQ06643 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBQ06643 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBQ06643 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBQ06643 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms