Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms