Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms