Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms