Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
MDM2Q00987 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms