Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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