Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRB1P82279 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB1P82279 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB1P82279 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB1P82279 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms