Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms