Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms