Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms