Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BACE1P56817 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BACE1P56817 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BACE1P56817 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BACE1P56817 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BACE1P56817 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BACE1P56817 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BACE1P56817 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BACE1P56817 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BACE1P56817 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BACE1P56817 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BACE1P56817 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BACE1P56817 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BACE1P56817 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BACE1P56817 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BACE1P56817 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms