Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME5P56597 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME5P56597 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME5P56597 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME5P56597 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME5P56597 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME5P56597 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME5P56597 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME5P56597 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME5P56597 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME5P56597 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME5P56597 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME5P56597 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME5P56597 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME5P56597 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms