Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms