Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DAP3P51398 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DAP3P51398 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DAP3P51398 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms