Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMPHP49418 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AMPHP49418 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMPHP49418 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMPHP49418 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPHP49418 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPHP49418 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPHP49418 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPHP49418 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPHP49418 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPHP49418 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPHP49418 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPHP49418 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPHP49418 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPHP49418 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPHP49418 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPHP49418 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPHP49418 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPHP49418 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPHP49418 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPHP49418 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPHP49418 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPHP49418 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPHP49418 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPHP49418 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPHP49418 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPHP49418 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPHP49418 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPHP49418 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPHP49418 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPHP49418 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPHP49418 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPHP49418 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPHP49418 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPHP49418 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPHP49418 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPHP49418 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPHP49418 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPHP49418 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPHP49418 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPHP49418 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPHP49418 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPHP49418 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPHP49418 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPHP49418 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPHP49418 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPHP49418 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPHP49418 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPHP49418 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPHP49418 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPHP49418 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPHP49418 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPHP49418 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPHP49418 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPHP49418 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPHP49418 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPHP49418 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPHP49418 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPHP49418 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPHP49418 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPHP49418 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
AMPHP49418 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPHP49418 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPHP49418 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPHP49418 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPHP49418 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPHP49418 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPHP49418 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPHP49418 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPHP49418 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPHP49418 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPHP49418 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPHP49418 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPHP49418 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPHP49418 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPHP49418 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPHP49418 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms