Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP2P42575 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP2P42575 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms