Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THBS4P35443 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
THBS4P35443 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
THBS4P35443 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THBS4P35443 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THBS4P35443 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms