Protein–RNA interactions for Protein: P35354

PTGS2, Prostaglandin G/H synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS2P35354 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGS2P35354 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTGS2P35354 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms