Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC3AP31941 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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APOBEC3AP31941 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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APOBEC3AP31941 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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APOBEC3AP31941 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3AP31941 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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