Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA13P31271 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA13P31271 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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