Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF1P30408 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms