Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA1P29973 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms