Protein–RNA interactions for Protein: P24311

COX7B, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX7BP24311 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COX7BP24311 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COX7BP24311 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms