Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRPH2P23942 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms