Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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