Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HRCP23327 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HRCP23327 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HRCP23327 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HRCP23327 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HRCP23327 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HRCP23327 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HRCP23327 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HRCP23327 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HRCP23327 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HRCP23327 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HRCP23327 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HRCP23327 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HRCP23327 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HRCP23327 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HRCP23327 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HRCP23327 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HRCP23327 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HRCP23327 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HRCP23327 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HRCP23327 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HRCP23327 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HRCP23327 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HRCP23327 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HRCP23327 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HRCP23327 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HRCP23327 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HRCP23327 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HRCP23327 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HRCP23327 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HRCP23327 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HRCP23327 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HRCP23327 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HRCP23327 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HRCP23327 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HRCP23327 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HRCP23327 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HRCP23327 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HRCP23327 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HRCP23327 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HRCP23327 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HRCP23327 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HRCP23327 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HRCP23327 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HRCP23327 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HRCP23327 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HRCP23327 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HRCP23327 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms