Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA1P21709 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms