Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1P21675 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF1P21675 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1P21675 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1P21675 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TAF1P21675 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1P21675 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1P21675 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1P21675 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1P21675 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms