Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NTF3P20783 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NTF3P20783 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NTF3P20783 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NTF3P20783 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NTF3P20783 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NTF3P20783 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NTF3P20783 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NTF3P20783 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NTF3P20783 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NTF3P20783 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NTF3P20783 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NTF3P20783 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NTF3P20783 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NTF3P20783 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NTF3P20783 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NTF3P20783 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NTF3P20783 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NTF3P20783 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NTF3P20783 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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