Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms