Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGCP20142 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGCP20142 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGCP20142 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGCP20142 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGCP20142 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGCP20142 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGCP20142 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGCP20142 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGCP20142 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGCP20142 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGCP20142 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGCP20142 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGCP20142 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms