Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF3P18847 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF3P18847 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF3P18847 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF3P18847 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF3P18847 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF3P18847 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF3P18847 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF3P18847 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF3P18847 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF3P18847 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF3P18847 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF3P18847 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF3P18847 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF3P18847 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF3P18847 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF3P18847 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF3P18847 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF3P18847 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF3P18847 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATF3P18847 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATF3P18847 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATF3P18847 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATF3P18847 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATF3P18847 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF3P18847 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF3P18847 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF3P18847 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF3P18847 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF3P18847 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF3P18847 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF3P18847 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF3P18847 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF3P18847 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF3P18847 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF3P18847 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF3P18847 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF3P18847 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF3P18847 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF3P18847 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF3P18847 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF3P18847 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF3P18847 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF3P18847 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF3P18847 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF3P18847 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF3P18847 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms