Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSPP15924 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSPP15924 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DSPP15924 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSPP15924 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSPP15924 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSPP15924 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSPP15924 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSPP15924 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSPP15924 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSPP15924 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSPP15924 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSPP15924 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSPP15924 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSPP15924 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSPP15924 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSPP15924 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms