Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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