Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAVP06756 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms