Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRB1P04280 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRB1P04280 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRB1P04280 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRB1P04280 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRB1P04280 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRB1P04280 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB1P04280 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB1P04280 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms