Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms