Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms