Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX58O95786 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX58O95786 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX58O95786 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX58O95786 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX58O95786 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX58O95786 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX58O95786 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX58O95786 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX58O95786 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX58O95786 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX58O95786 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX58O95786 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX58O95786 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX58O95786 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX58O95786 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX58O95786 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX58O95786 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX58O95786 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX58O95786 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX58O95786 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms