Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLDN9O95484 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CLDN9O95484 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CLDN9O95484 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CLDN9O95484 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CLDN9O95484 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CLDN9O95484 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CLDN9O95484 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CLDN9O95484 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CLDN9O95484 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CLDN9O95484 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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CLDN9O95484 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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