Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 RALY-204ENST00000413297 766 ntTSL 523.01■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 119
SF3B1O75533 RALY-202ENST00000333552 786 ntTSL 322.11■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 119
SF3B1O75533 CCDC91-209ENST00000539904 989 ntTSL 53.94□□□□□ -1.783e-6■■■■■ 118.9
SF3B1O75533 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.145e-6■■■■■ 118.8
SF3B1O75533 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.838e-7■■■■■ 118.7
SF3B1O75533 TNFRSF12A-203ENST00000571351 1678 ntTSL 221.78■■□□□ 1.088e-7■■■■■ 118.7
SF3B1O75533 TNFRSF12A-205ENST00000574699 583 ntTSL 221.24■□□□□ 0.998e-7■■■■■ 118.7
SF3B1O75533 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.998e-7■■■■■ 118.7
SF3B1O75533 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.278e-7■■■■■ 118.7
SF3B1O75533 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.198e-7■■■■■ 118.7
SF3B1O75533 KLHL18-202ENST00000433449 560 ntTSL 420.39■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 118.7
SF3B1O75533 KLHL18-203ENST00000437353 463 ntTSL 219.58■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 118.7
SF3B1O75533 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.134e-6■■■■■ 118.7
SF3B1O75533 WDHD1-202ENST00000420358 3722 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 118.7
SF3B1O75533 TMEM87B-204ENST00000463427 637 ntTSL 38.03□□□□□ -1.124e-6■■■■■ 118.7
SF3B1O75533 MPV17-222ENST00000621470 671 ntTSL 319.52■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 MPV17-223ENST00000622003 794 ntTSL 518.18■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 IKBKB-205ENST00000517812 523 ntTSL 317.76■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 MPV17-221ENST00000621183 896 ntTSL 517.64■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 MPV17-212ENST00000428910 575 ntTSL 515.63■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 MPV17-215ENST00000486898 565 ntTSL 415.63■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 MPV17-219ENST00000617583 965 ntTSL 215.63■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 IKBKB-211ENST00000519733 527 ntTSL 415.55■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 IKBKB-203ENST00000517388 577 ntTSL 414.73□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 MPV17-211ENST00000426513 905 ntTSL 314.7□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 MPV17-210ENST00000415514 597 ntTSL 514.51□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 IKBKB-208ENST00000518647 1543 ntTSL 214.18□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 IKBKB-215ENST00000520320 628 ntTSL 513.52□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 ZMYM3-209ENST00000489332 5723 ntTSL 511.77□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 DENND1A-206ENST00000473039 4800 ntTSL 1 (best)11.51□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 ZMYM3-201ENST00000314425 5536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.752e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 MPV17-202ENST00000357186 2011 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 ZMYM3-205ENST00000373984 5253 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 CCDC144NL-203ENST00000539484 751 ntTSL 39.98□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 HERC2-209ENST00000567869 3523 ntTSL 29.19□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 POLA1-205ENST00000494204 806 ntTSL 33.97□□□□□ -1.772e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 RAB11FIP4-209ENST00000583755 567 ntTSL 421.96■■□□□ 1.115e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.925e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.885e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.726e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.666e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.16e-6■■■■■ 118.6
SF3B1O75533 SLC43A1-202ENST00000524995 953 ntTSL 321.69■■□□□ 1.063e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 SLC43A1-207ENST00000533066 999 ntTSL 319.66■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 SLC43A1-210ENST00000534105 580 ntTSL 519.22■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.563e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 SLC43A1-206ENST00000530159 788 ntTSL 517.65■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 DHODH-205ENST00000572887 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 RNF207-201ENST00000377939 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 DHODH-208ENST00000574309 607 ntTSL 511.56□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 DHODH-207ENST00000573922 427 ntTSL 510.1□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MAGI3-206ENST00000486456 897 ntTSL 521.97■■□□□ 1.117e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 ANAPC10-217ENST00000613466 1674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.474e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 ANAPC10-204ENST00000502651 867 ntTSL 211.39□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 ANAPC10-218ENST00000641499 1538 nt10.74□□□□□ -0.694e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 ANAPC10-207ENST00000506851 471 ntTSL 39.6□□□□□ -0.874e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 ANAPC10-209ENST00000507656 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.94e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 ANAPC10-211ENST00000510270 963 ntTSL 38.52□□□□□ -1.054e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.054e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 ANAPC10-215ENST00000514390 794 ntTSL 38.46□□□□□ -1.064e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 ANAPC10-214ENST00000513054 689 ntTSL 37.53□□□□□ -1.24e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.344e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 ANAPC10-212ENST00000511466 687 ntTSL 24.51□□□□□ -1.694e-6■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-208ENST00000435155 904 ntTSL 521.81■■□□□ 1.087e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-219ENST00000474703 577 ntTSL 320.87■□□□□ 0.937e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.817e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.817e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.817e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-232ENST00000492494 998 ntTSL 520■□□□□ 0.797e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.667e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-220ENST00000475516 1677 ntTSL 1 (best)19.07■□□□□ 0.647e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-228ENST00000483642 1080 ntTSL 518.72■□□□□ 0.597e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-213ENST00000462387 820 ntTSL 318.72■□□□□ 0.597e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-230ENST00000485484 810 ntTSL 318.55■□□□□ 0.567e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.417e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.297e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-207ENST00000412971 772 ntTSL 316.8■□□□□ 0.287e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.277e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.277e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-225ENST00000481571 1742 ntTSL 1 (best)16.71■□□□□ 0.277e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.267e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-212ENST00000461495 965 ntTSL 516.27■□□□□ 0.27e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.197e-7■■■■■ 118.5
SF3B1O75533 MUTYH-217ENST00000467940 989 ntTSL 515.81■□□□□ 0.127e-7■■■■■ 118.5
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1514.2 ms