Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTNSO60931 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNSO60931 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms