Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CYTIPO60759 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CYTIPO60759 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CYTIPO60759 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CYTIPO60759 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CYTIPO60759 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CYTIPO60759 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CYTIPO60759 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CYTIPO60759 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CYTIPO60759 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CYTIPO60759 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CYTIPO60759 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTIPO60759 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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