Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA2O43921 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms