Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HTATSF1O43719 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms