Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DENRO43583 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DENRO43583 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms