Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTSS1O43312 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms